제3종 IFN의 진화
III형 인터페론은 인터페론 람다스라고도 알려져 있으며, 2003년 IFN 계열의 발견 이후 가장 최근에 추가된 것이다. 당초 IFNλ은 IFN 형과 유사한 방식으로 인터페론 자극 유전자의 발현을 유도하고 항바이러스 성질을 발휘하는 것으로 입증되었다. 그러나 IFNλ은 I형 IFN과 표현 및 기능이 크게 중복된다고 설명되어 왔으나, III형 IFN도 I형 IFN과 구별되는 기능을 가지고 있다는 것이 점차 명확해졌다. 수용체가 보편적으로 표현되는 I형 IFN과는 대조적으로 III형 IFNs 신호와 기능은 주로 호흡기 및 위장 작용과 같은 장벽 상피 표면에서, 혈액-뇌 장벽에서 이루어진다. 타입 III IFN에 대한 고유한 기능의 추가 지원에서, 인간 내 IFNL 유전자의 단일 뉴클레오티드 다형성은 바이러스 감염의 결과와 강하게 관련되어 있다. 이러한 생물학적 연결은 항바이러스 면역 반응을 촉진하는 데 있어 IFNλ의 역할을 강조하는 쥐의 연구에 의해 더 직접적으로 지원되었다. 이 리뷰에서는 유형 III IFN에 대한 현재의 이해와 다양한 면역세포 하위유형 및 바이러스 감염에서 유형 IIFN과 기능이 어떻게 유사하고 다른지에 대해 논의한다. I형 IFN은 바이러스 감염 이후 빠르게 생성되어 분비된다. 이후 그것은 중요한 숙주 방어 메커니즘으로서 항바이러스 상태를 시작하도록 주변 세포에 신호를 보낸다. 인간에는 IFNα뿐만 아니라 IFNβ, IFNε, IFNκ, IFNκ, IFNΩ의 13가지 아형이 있다. I형 IFN은 인간의 경우 9번 염색체에, 생쥐의 경우 4번 염색체에 군집한 무내 유전자다. 포유류, 조류, 파충류, 양서류에서 IFN 유전자는 인트론이 부족하며, 이는 그들의 기원이 역변환 유전적 요소에서 비롯되었을 수도 있음을 시사한다. 단, 어항 인트론 에 IFN 타입이며, IL-10 계열의 공통 조상을 통해 발생한 것으로 생각된다. 양서류는 최근 인트론 성분과 인트론 없는 타입 IFN 유전자를 모두 가지고 있다고 설명되어 왔다. 현재 인터페론 진화에 대한 이해는 독립적 또는 역변환적 사건이 파충류, 조류, 어류에서 인트론리스형 IFN 로쿠스의 조상이었을지도 모르는 인트론리스형 IFN 유전자의 발생으로 이어졌는지 여부를 구분하지 못하고 있다. IFN 람다 가족 구성원은 처음에는 인터루킨-28과 IL-29로 명명되었으며, 공통 IL-10 수용체 하위단위 2를 통해 신호를 보내면서 IL-10 가족 유전자로 분류되었다. 인간은 IFNL1, IFNL2, IFNL3, IFNL4 등 4개의 IFNL 유전자를 가지고 있다. IFNL 유전자는 테트라포드에 존재하지만 I형 IFN에서 볼 수 있는 진화적 다양성과는 대조적으로 척추동물 전체에 걸쳐 IFN은 4개 로쿠스로 구성된다. IFN 람다스는 기능적으로는 IFN과 가장 유사하지만 구조적으로는 IL-10 계열의 구성원과 유사하다. 타입 III IFN은 단계 0 intron–exon 구조를 가지며 신호에 대한 수용체 이질화 복합체의 일부로 IL-10R2의 구성요소를 이용한다. I형 IFN(15–19% aa) 또는 IL-10(11–13% aa)과 비교할 때 III형 IFN의 시퀀스 ID는 낮다. 타입 III 유전자 중에서 IFNL1과 IFNL2는 81% 아미노산 아이덴티티를 공유하는 반면, IFNL2와 IFNL3는 96% 아미노산 아이덴티티를 공유한다. IFNL4는 아미노산 아이덴티티의 28%만 다른 IFNL 유전자와 공유하므로 별도의 중복 이벤트를 통해 IFNL4가 유입되었을 수 있다. 타입 III IFN의 진화 이력은 여전히 불완전하지만, 타입 III IFN에 대한 진화적 제약조건을 이해하기 위해 많은 그룹이 작업하고 있다. Manry 외 연구진은 진화 유전학 접근법을 활용하여 타입 I과 타입 III IFN, 그리고 심지어 이러한 타입 각각 내의 개별 유전자가 구별되는 진화 압력을 받아왔다는 것을 입증했다. 이 작업은 병원체 방어를 위해 이러한 IFN 제품군에 대한 중복 및 구체적이고 고유한 역할을 모두 제안한다. 인간과 대조적으로 생쥐에서는 Ifnl2와 Ifnl3만 기능하며, Ifnl1과 Ifnl4는 유사 생성물이다. 인간과 뮤린 이프렌 유전자 구성의 차이에도 불구하고, 뮤린 연구는 인간 감염과 관련이 있는 항바이러스 및 면역 조절 기능에 대한 중요한 통찰력을 제공했다. 예를 들어, 머린 천식 모델에서 인터페론 람다 치료는 Th1-편향 면역 반응으로 이어지는 것으로 입증되었다. 인간의 경우, IFNλ은 인플루엔자 바이러스 백신 접종(15) 동안 Th1 반응을 강화시킨다. IFN은 패턴인식 수용체에 의한 병원체 관련 분자 패턴의 검출에 따라 표현된다. LIG-I 유사 수용체에 의한 PAMP를 감지하면 미토콘드리아 항바이러스 신호 단백질을 미토콘드리아 관련 막이나 과록시솜에 채용하여 전사인자 NF-κB와 인터페론 규제인자가 활성화되어 IFN과 IFN 21의 발현을 유도한다. 다중 통행료 유사 수용체는 타입 I과 III IFN의 발현을 유도한다. 타입 I과 타입 III IFN을 유도하는 신호와 경로는 크게 중첩되지만, DNA 감지 경로에는 한가지 주목할 만한 예외가 존재한다. HEK293과 THP-1 세포에서 세포질 센서 Ku70에 이것을 결합하면 IF if1과 IFNn2/3의 생성을 유도하지만 IFN 타입은 아니다. DNA나 대상포진 바이러스-2 감염에 이어 Ku70에 대한 이것의 결합은 IRF1과 IRF7 외에 SUNG의 모집과 그에 따른 IRF3 활성화로 이어진다. 이 소설 IFNn 특이 IFN 유도가 감지에 따른 다른 세포 유형에 존재하는지 여부는 아직 조사되지 않은 흥미로운 가능성이다. I형과 III IFN형은 감염 후 모두 유도되지만, 이들 유전자의 전사는 일시적으로 조절된다. I형 IFN은 신속하게 유도되고 해결되며, IFNL 유전자의 지연되지만 지속적인 유도가 뒤따른다. 타입 I과 타입 III IFN의 구별되는 시간적 유도 패턴을 담당하는 메커니즘은 현재 알려져 있지 않지만, 이는 다른 신호 분자나 전사 인자의 활용 때문일 수 있다. IFNL1과 IFNL3 추진자는 IRF1, IRF3, IRF7 및 NF-164B를 위한 결합 사이트를 보유하고 있다. 그러나 IFN 형식과 대조적으로, 연구는 IFNL의 전사가 주로 NF-164B에 의존하고 있으며, IFNL의 강력한 유도를 위해 IRF와 NF-164B 신호의 활성화가 모두 필요하다고 제안했다. PRR에 의한 PAMP 참여에 따른 유도형 I 및 III IFN에서 IRF와 NF-180B에 대한 차등 요건은 잠재적으로 I형 IFN과 비교한 III IFN의 전사적 규제의 시간적 차이에 기여할 수 있다. 성인 뮤린 모델에서 로타바이러스 감염에 이어 1형과 3형 IFN이 모두 생산되지만, 장내 상피세포는 3형 IFN에 우선적으로 반응해 장내 항바이러스 방어에서 IFN의 지배적인 역할을 시사한다. 또한 III형 IFN은 바이러스 감염에 대응하여 상피세포와 골수세포에 의해 점막현장에서 더욱 풍부하게 생산된다. IEC에 의한 타입 III IFN의 이러한 우선 유도를 위한 메커니즘은 완전하게 해명되어야 하지만, 부분적으로는 PAMP 센싱에 이어 상피세포에 풍부하게 존재하는 과산화솜에 MAVS 국산화 시 IFNn을 우선 유도에 기인할 수 있다. 또 다른 가능한 메커니즘은 상피 장벽 표면에 존재하는 정의되지 않은 조직 특정 요인들이 B형 간염 및 C형 간염 바이러스 감염 시 간세포에서 IFNλ 반응과 유사하게 I형 IFN에 대해 IFN을 촉진할 수 있다는 것이다. 또한 IFNλ은 피드-포워드 패션에서 인터페론 자극 유전자와 유사한 IFN 유형으로 유도될 수 있다. IFNL의 이러한 형식 I IFN 강화는 TLR 표현을 증가시키는 형식 I IFN의 능력에 최소한 부분적으로 기인하지만, 이 공동 규정의 기능적 결과는 시험해야 한다. 전반적으로 IFNλ 고유 마우스 모델과 리간드 및 수용체용 항체 감지 시약이 부족하여 IFNλ의 면역 기여도를 결정하는 데 있어 진척이 느려졌다. IFNλR이 부족한 전신 녹아웃 생쥐가 존재하지만, 최근 보고된 플록스 IFNrR 모델을 활용하는 생쥐의 연구에 의해 체내 다양한 조직과 세포 유형에서 IFN signaling 신호 역할의 해부가 진전될 것이다. 또 최근에는 IFNλ2 사이토카인 리포터 마우스가 개발되고 있다. 이러한 새로운 모델은 체내 IFNn의 고유한 기능을 이해하는 데 있어 급속한 발전으로 이어질 가능성이 높다. I형 및 III형 IFN의 일반적인 유도 및 신호 캐스케이드는 그림 1.1에 요약되어 있다. I형과 III형 IFN은 구별되는 수용체 이질화 복합체를 통한 각 신호를 참조한다. I형 IFN은 대부분의 세포에서 광범위하게 표현되는 IFNAR1과 IFNAR2로 구성된 수용체 복합체에 결합된다. IFNλR1과 IL-10R2로 구성된 이질 수용체를 통한 IFNλ 신호, IL-10R2는 IL-10 사이토카인 계열 구성원이 신호를 위해 광범위하게 표현 및 공유하는 수용체 하위 단위다. 이와는 대조적으로 IFN1R1의 표현은 상피세포, 골수세포의 부분 집합, 신경세포로 훨씬 제한된다. IFN은 JAC-STAT 경로 활성화 외에도 PI3K 및 MAPK 신호 캐스케이드도 활성화한다. 아마도 IFN과 많은 다른 사이토카인 사이의 이러한 신호 경로의 공유 활용은 다양한 맥락과 위치에서 항바이러스 및 면역 반응을 변조하는 IFN의 다양한 역할을 설명하는 데 도움이 될 수 있다. 각 수용체에 대한 서로 다른 친화력이 IFN 하위 유형들 사이에 존재하며, 이는 수용체 결합 시 신호 강도를 변화시킬 수 있으며, 따라서 IFN에 의한 면역 반응을 제어하기 위해 잠재적으로 또 다른 규제 층을 추가할 수 있다. 멘도자 외 연구진은 사이토카인의 구조를 식별하기 위해 고선호도 IFNλ3을 개발했다. 시험관내 실험을 사용했을 때 이 고선호도 IFNλ3은 HCV와 B형 간염 바이러스의 항바이러스 활성이 강화된 것으로 밝혀졌다. 이러한 결과는 IFN과 그 수용체 사이의 상호작용의 강도를 향상시키면 다운스트림 기능을 변조할 수 있다는 생각을 뒷받침한다. 이 특별한 연구는 항바이러스 및 반선호작용 반응을 조사했지만, 고선호도 IFNλ 분자의 공학이 면역의 다른 측면을 변화시킬 수 있는지 여부를 식별하는 것은 흥미로울 것이다. 최근에 해결된 IFNλ3/IFNλR1/IL-10R2 신호 복합 구조는 수용체 복합체 및 다운스트림 신호 강도에 대해 서로 다른 친화력을 갖는 IFNλ 치료 작용제 개발에 도움이 될 수 있다. IFNλR 수준에서 IFNn에 대한 대응을 규제하는 다른 메커니즘은 생각할 수 있다. 예를 들어 IFNλR1 서브유닛의 제한된 특성 외에도 IFNλ을 잠재적으로 규제 메커니즘으로 분리할 수 있는 수용성, 분비성 IFN1R1이 설명되었다. 요약하면 IFN 신호 경로가 유사하거나 중복되는 세포내 신호 경로를 활성화할 수 있는 다른 사이토카인에 의한 자극과 함께 어떻게 기능하는지에 대한 복잡한 상호작용을 해부하기 위한 추가 연구가 필요하다. 인터페론 람다는 HCV, HBV, 인플루엔자 바이러스, 라이노바이러스, 호흡기세포융합바이러스, 림프구 교리증식바이러스, 로타바이러스, 레오바이러스, 노로바이러스, 웨스트나일 바이러스를 포함한 광범위한 바이러스 감염에서 중요하다. IFNλ 항바이러스 반응에 대한 이러한 연구들 중 상당수는 간, 호흡기, 위장 점막을 감염시키는 바이러스에 집중되어 있으며, 최근에는 혈액-뇌장벽을 건너 신경침습성 바이러스 감염을 일으키는 바이러스에 집중되어 있다.
IFNλR 녹아웃 생쥐를 이용한 생체내 실험 접근방식은 인플루엔자 A 바이러스, 사스 코로나바이러스, RSV, 폐의 인간 메타포클레오바이러스 수준뿐만 아니라 위장의 노로바이러스, 레오바이러스, 로타바이러스 수준을 제어하는 IFNλ 신호의 중요성을 강조하였다. 또한 I형과 III형 IFN형도 암, 기생충 감염, 곰팡이 감염, 그리고 리스테리아 모노키토제네스와 살모넬라 티푸리움, 살모넬라균과 같은 잠재적 호흡기 병원균을 포함하는 여러 가지 세균 감염에 대한 역할을 가지고 있다는 것도 주목할 만하다. 이러한 다른 설정에서 유형 I과 유형 III IFN의 기여도가 최근에 검토되었으므로 여기서는 더 이상 자세히 설명하지 않을 것이다. 복수의 보고서에서는 감염에 대응한 IFNα/β 및 IFNn에 대한 중복 역할을 제안하였다. 그러나 IFNα/β와 IFNλ의 감염에 대한 뚜렷한 기여가 인정되기 시작했다. 표 11은 IFNλ이 체외 및 체내 감염에서 알려진 IFNα/β 역할과 비교하여 기여하는 것으로 입증된 바이러스 감염을 요약한다. IFNλ과 IFNα/β의 차이가 여전히 조사되고 있는 동안, IFNλ에 의해 유도된 ISG 반응이 IFNα/β에 비해 감소하는 반면, 체내 IFNλ은 IFNα/β에 비해 훨씬 덜 염증성이 있다는 것이 연구에서 입증되었다. 흥미롭게도 IFN은 I형 IFN에 비해 염증 반응이 적음에도 불구하고 많은 항바이러스 특성을 유지하고 있다. 이는 HCV 감염에 대한 IFNα의 대체 치료제로서 임상 사용을 위한 IFNλ의 개발을 촉진시켰다. HCV 감염을 해소할 수 있는 직접 작용 항바이러스제가 출시된 결과 치료제로서의 IFNn에 대한 HCV 분야 내 열정이 식었다. 그러나 IFNλ의 잠재적인 항바이러스 및 덜 염증성 기능을 치료제로 활용하는 것은 다른 간 바이러스 감염의 치료에 유용할 수 있다. 보다 최근적이고 광범위한 가설은 IFNn 치료도 호흡기 바이러스 감염을 통제하는 데 이용될 수 있다고 가정한다. 여러 실험 연구에서 IFNλ2 또는 IFNλ3을 사용한 생쥐의 예방적 치료와 치료적 치료는 IFNα 또는 IFNβ 치료와 유사하게 IAV 폐 티저를 제어하는 것으로 나타났다. 중요한 것은 IFNλ 치료는 IFNα 치료와 관련된 과도한 폐 염증을 피했다는 점이다. 이 연구의 저자들은 I형과 III형 IFN 둘 다의 유도에 대해 알려진 IAV NS1 매개 블록을 극복한 사이토카인 둘 중 하나를 이용한 치료를 추측했다. 본 연구에서 사용된 IFNλ 치료는 폐모세포와 항원 표시 세포의 반응을 변화시켰지만, 이러한 특정 세포군에 대한 IFNλ의 잠재적 직접적 영향은 항바이러스 치료 환경에서 특징지어지지 않았다. IFNL 유전자의 기능과 면역 조절 능력은 게놈 전체 연관 연구에서 확인되고 전염병 결과와 강하게 상관되는 다수의 단일 뉴클레오티드 다형성에 의해 더욱 영향을 받는다. 이러한 사항들은 다른 곳에서 매우 상세하게 설명되었다. 여기서는 SNP의 기능과 면역 반응에 대한 직접적인 결과의 메커니즘이 설명되어 있는 이러한 SNP와 관련된 보다 최근의 발견에 대해 간략히 논의한다. 이러한 SNP가 상관적 표현형 이외의 감염과 질병에 대한 면역력에 직접적인 영향을 미치는 것을 이해하는 데 상당한 진전이 있었다. IFNL3의 여러 SNP는 비록 최근까지 이러한 SNP가 제공하는 규제의 메커니즘을 이해하지 못하였지만, 인터페론 기반 치료법과 HCV의 자연적 간격에 대한 반응과 관련이 있다. 우리 그룹은 최근에 G alle이 HCV learance와 상관관계가 있는 반면, 불리한 T alle은 HCV 지속성과 상관관계가 있는 하나의 IFNL3 SNP 메커니즘을 설명하였다. 구체적으로 HCV는 IFNL3의 3 3 미통보 영역을 대상으로 하는 2개의 마이크로RNA의 발현을 조절하여 바이러스 지속성을 허용하는 것으로 조사되었다. T alle은 이러한 HCV 유도 microRNA와 IFNL3의 AU-rich 요소 매개 붕괴의 강화된 결합을 허용하는 3 3 UTR의 변화를 유도하여 사이토카인의 표현과 HCV 감염 결과에 영향을 미친다. 흥미롭게도, 이와 동일한 마이크로RNA는 또한 타입 III IFN의 miR-208b 및 miR-499a-5p 규제와는 구별되는 메커니즘인 IFNAR1의 발현을 하향 조절함으로써 HCV 감염 간세포에서 타입 IIFN 신호도 약화시킨다. 기계론적 연구는 IFNλ4의 생산에 영향을 미치는 또 다른 SNP의 면역학적 결과도 정의했다. 약 40%의 백인이 IFNL4 유전자에 대한 개방된 판독 프레임을 가지고 있다. 그러나 IFNL4의 프레임-변형 돌연변이는 그것을 유사 동성으로 렌더링한다. 흥미롭게도 G 유전자 변종 인코딩 전체 길이 IFNL4는 HCV의 지속성과 강한 상관관계가 있다. IFNL4가 항바이러스 반응을 감쇠시키는 세포내 역할을 할 수 있다는 가설이 제기되었지만 입증되지는 않았다. 그러나 dG IFNL4 알레르기가 rs12979860 및 rs4803217에서 덜 유리한 IFNL3 유전자형과 연결되어 있기 때문에 적어도 부분적으로는 간접적인 효과일 수 있다고 추측된다. 이 연구는 IFNλ4가 IFNλ3과 유사한 항바이러스 기능을 가지고 있음을 확인했다. 단, IFNL3에 비해 낮은 수준에서 기능적인 전체 길이 IFNL4가 유도되며, 내측 스플라이스 이소폼과 약한 폴리아데닐화 신호로 인해 번역이 잘 되지 않는다. 흥미롭게도 인간이 아닌 영장류들은 dG>를 포함하고 있지 않다. TT 프레임-이동 돌연변이는 여전히 IFN44 변환을 제한하지만, 인트론-보존 스플라이스 이소폼과 약한 폴리A 신호의 생산에 의해, 기능적 IFN44 이소폼이 인간에게 유사성 프레임-이동 돌연변이가 발생하기 전에 대해 선택되었음을 시사한다. IFNL4가 왜 억제되고, 아마도 유사 생성을 진행 중인지에 대해서는 현재도 불분명하다. 아마도 IFNL4는 IFNL3의 유전적 복제를 통해 더 최근에 발생하였지만 다른 IFN에서 발생한 것과 유사한 IFN3과 구별되는 특정 기능을 개발하지 않았다. 불리한 IFNL3 유전자형의 연계라는 교란 요인이 없는 미래 연구는 항바이러스 면역성에 대한 생체 활성 IFNλ4의 기능을 밝혀낼 수 있다. 또한 질병에 대한 IFNL SNP 규제의 메커니즘을 구문 분석하는 더 많은 연구가 IFNλ 치료법의 개발과 기능성에 중요한 통찰력을 제공할 수 있다. 자가면역성의 개발과 발현에 대한 I형 IFN의 기여도는 잘 확립되어 있다. 제1형 IFN은 전신 루푸스 에리테마토스, 아이카르디-구티에레스 증후군, 쇼그렌 증후군, 제1형 당뇨병, 건선과 같은 전신 자가면역 질환에서 일반적으로 상향 조정된다. 성인 환자의 절반 이상, 소아 환자의 90% 이상이 SLE로 말초 IFNα가 상승하였다. 기계론적 연구는 IFN 유형의 주요 공급원인 플라스마시토이드 덴드리트리틱 세포가 인간과 생쥐의 SLE 병변에서 농축되는 것을 확인했다. 흥미롭게도, 타입 III IFN은 자가면역질환의 악화와는 관련이 없는 것 같다. 실제로 쥐의 관절염 모델에서 증상에 대한 치료를 위해 III IFN 타입이 입증되었다. 또한 인간에게 자가면역이 될 수 있는 병인 대장염의 피부염 모델에서 IFNλ 신호는 특히 중성미자에 있는 IFNλ 신호는 활성산소의 방출 감소와 장내 병리학 예방으로 이어진다. 또 IFNλR1이 부족한 생쥐는 천식 모델에서 질병을 악화시켰다. 천식에서 잠재적으로 보호될 수 있는 IFNn의 이러한 역할은 인간에게도 탐구되기 시작했다. 한 최근 논문은 전신 경화증과 IFNλ1 수준 상승의 상관관계를 확인했지만, 자기면역질환에서 IFN의 역할을 명확히 규명하는 기계론적 연구는 부족하다. 흥미롭게도, pDC는 IFNλR을 표현하고 IFNλ에 직접 반응하는 것으로 나타났다. IFNλ 신호가 면역의 맥락에서 pDC에서 변경되는지는 면역 매개 치료에 영향을 미칠 수 있는 흥미로운 질문이다. 병원균에 대한 효과적인 면역반응을 위해서는 숙주 면역병리학을 동시에 피하면서 감염을 억제하기 위한 인터페론의 최적 유도가 중요하다. IFNλ은 일반적으로 IFN형보다 염증성이 적은 것으로 간주되지만, IFNλ의 직접 항바이러스 작용 이외의 면역반응 규제에 대한 완전한 이해는 대부분 알려지지 않았다. 주로 바이러스 감염의 맥락에서 이루어진 최근의 연구는 IFN이 광범위한 선천적 및 적응적 면역 반응의 규제에 대한 기여를 설명하기 시작했다. IFNα/β와 IFNλ의 역할은 많은 바이러스 감염에서 유사하지만, 몇 가지 주목할 만한 차이가 존재한다. 예를 들어 인플루엔자 바이러스에 감염된 생쥐를 치료하면 IFNα에 감염된 생쥐가 폐염증 및 사망률을 증가시키는 반면 IFNn은 보호적이다. 또 IFNλ은 레오바이러스, 로타바이러스 등 장내 바이러스 병원체에 대한 보호에도 중요하다. 이는 IEC가 IFN에 강력하게 대응하지만 IFN 유형은 아닌 생체내에 반응하기 때문일 수 있다. 그러나 장 내 다른 면역세포 유형에서 IFNλ에 대한 다른 중요한 역할도 있는데, 예를 들어 머린 중성미자 등이 조사되기 시작했을 뿐이다. 호스트 방어에서 IFN의 특정 기능을 이해하기 위한 지속적인 노력의 일환으로, 선천적 및 적응적 면역에 기여하는 서로 다른 조직과 세포 유형에 대한 구체적인 영향을 조사하기 위해 고안된 더 많은 연구가 유용할 것이다.